Продукти

Неалкогольна жирова хвороба печінки (НАЖХП) має широкий спектр хворобливих станів, починаючи від легкого стеатозу, що характеризується ненормальною затримкою ліпідів у клітинах печінки, до стеатогепатиту (НАСГ), що демонструє накопичення жиру, запалення, роздування та деградацію гепатоцитів і фіброз.Зрештою, стеатогепатит може призвести до цирозу печінки та гепатоцелюлярної карциноми. У цьому дослідженні ми проаналізували три різні лінії мишей, A/J, C57BL/6J та PWD/PhJ, які демонструють різні ступені стеатогепатиту при введенні 3,5-діетоксикарбоніл -1,4-дигідроколідин (DDC), що містить дієту.Аналіз експресії генів RNA-Seq, аналіз білків і метаболічний профіль були застосовані для ідентифікації диференціально експресованих генів/білків і порушених рівнів метаболітів у зразках печінки мишей після обробки DDC.Аналіз шляху виявив зміну метаболізму арахідонової кислоти (AA) і S-аденозилметіоніну (SAMe) на інших шляхах.Щоб зрозуміти метаболічні зміни метаболізму арахідонової кислоти у світлі профілів експресії захворювання, була розроблена та оптимізована кінетична модель цього шляху відповідно до рівнів метаболітів.Згодом цю модель використовували для вивчення in silico ефектів потенційних мішеней ліків для стеатогепатиту. Ми визначили метаболізм AA/ейкозаноїдів як сильно порушений у мишей, індукованих DDC, використовуючи комбінацію експериментального підходу та підходу in silico.Наш аналіз метаболічного шляху AA/ейкозаноїдів показує, що 5-гідроксіейкозатетраєнова кислота (5-HETE), 15-гідроксіейкозатетраєнова кислота (15-HETE) і простагландин D2 (PGD2) порушені у мишей DDC.Далі ми демонструємо, що динамічну модель можна використовувати для якісного прогнозування метаболічних змін на основі даних транскриптомії в контексті захворювання.Крім того, метаболізм SAMe був ідентифікований як порушений через лікування DDC.Кілька генів, а також деякі метаболіти цього модуля демонструють відмінності між A/J і C57BL/6J, з одного боку, та PWD/PhJ, з іншого.