Продукти

Інфрачервона спектроскопія була використана для картографування взаємодії субстрат-білок: конформаційні зміни Са(2+)-АТФази саркоплазматичного ретикулуму після зв’язування нуклеотидів і фосфорилювання АТФази відстежували за допомогою субстратного АТФ і аналогів АТФ (2'-дезокси-АТФ, 3 '-дезокси-АТФ і інозин 5'-трифосфат), які були модифіковані в конкретних функціональних групах субстрату.Модифікації 2'-OH, 3'-OH і аміногрупи аденіну зменшують ступінь індукованих зв'язуванням конформаційних змін АТФ-ази, при цьому особливо сильні ефекти спостерігаються для двох останніх.Це демонструє структурну чутливість комплексу нуклеотид-АТФаза до окремих взаємодій між нуклеотидом і АТФазою.Усі досліджувані групи важливі для зв’язування, і взаємодії даної лігандної групи з АТФазою залежать від взаємодії інших лігандних груп.Фосфорилювання АТФ-ази спостерігалося для ITP і 2'-дезокси-АТФ, але не для 3'-дезокси-АТФ.Немає прямого зв’язку між ступенем конформаційних змін при зв’язуванні нуклеотидів і швидкістю фосфорилювання, показуючи, що повний ступінь конформаційних змін, індукованих АТФ, не є обов’язковим для фосфорилювання.Як спостерігалося для комплексу нуклеотид-АТФаза, конформація першого фосфорильованого проміжного продукту АТФази E1PCa(2) також залежить від нуклеотиду, що вказує на те, що стани АТФази мають менш однорідну конформацію, ніж передбачалося раніше.